O segundo tempo começou muito amarrado no meio do campo. Os dois times trocaram muitos passes, mas sem jogadas de perigo. Aos 85 minutos, Piqué foi substituído e saiu do campo mancando. Messi teve a chance de fazer o gol da classificação aos 88 minutos, mas chutou a bola na mão do goleiro Simón.

O castigo para o Barça veio aos 93 minutos, Ibai Gómez cruzou da direita, Iñaki Williams tomou a frente de Busquets e cabeceou no canto direito de Ter Stegen.

Com esse resultado o Athletic Bilbao está na semifinal da Copa do Rei. Pela primeira vez desde a temporada 2009/10, a competição não terá os gigantes Real Madrid e Barcelona na semifinal.